Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms