Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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