Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms