Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms