Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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