Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ssbp4Q3U4B1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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