Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf40Q3U319 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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