Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf149Q3U2C5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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