Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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