Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tatdn3Q3U1C6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms