Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms