Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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