Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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