Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm21440Q3TTD8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm21440Q3TTD8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21440Q3TTD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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