Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd3Q14AI6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms