Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q149G0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q149G0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q149G0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q149G0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q149G0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms