Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms