Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms