Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms