Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms