Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms