Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms