Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms