Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms