Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms