Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gdf3Q07104 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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