Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp2Q06335 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms