Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms