Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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