Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms