Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox8Q04886 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms