Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms