Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms