Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx2Q03358 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms