Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms