Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mmp11Q02853 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Mmp11Q02853 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp11Q02853 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mmp11Q02853 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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