Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlh1Q02576 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nhlh1Q02576 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nhlh1Q02576 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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