Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HmgcrQ01237 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms