Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfaQ00731 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms