Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SeleQ00690 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms