Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms