Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms