Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb4P99026 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms