Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt86P97861 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt86P97861 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt86P97861 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt86P97861 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt86P97861 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms