Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlkP97793 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlkP97793 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlkP97793 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms