Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smyd1P97443 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms