Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme1P97371 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme1P97371 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms