Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1b3P97370 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms