Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhodP97348 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhodP97348 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhodP97348 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhodP97348 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms