Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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